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1275年，源平合战爆发，源义经和平清盛两位武士贵族率领军队在伊势湾内激战，由于海上的风力，平军的战舰始终处于下风，眼看就要失利了，这时，源义经的哥哥源赖朝突然带着自己的船队出现，平军见此立刻转变风向，将源赖朝的船队包围起来。 正当源赖朝愁眉不展之时，远处又出现了一支船只，船上挂着日本和源家的旗帜，原来这是源义经派出接应的父亲源义仲的援兵。
得知消息的平清气极败坏，他亲手砍断了自己的爱马“枣骝”的缰绳，命令骑兵发起冲锋，一举击败了源义仲的部队。虽然暂时取得了胜利，但平清盛的心情却无法因此而好转——源家军中有一员猛将名叫木津贞宗，武艺高强且作战勇敢，平清盛的弟弟平氏亲雄在与他的战斗中，右臂中箭，差点丧命。
为了消灭这个让人生畏的源家悍将，平清盛亲自上阵攻击，但是却被木津贞宗用长枪将骑枪横扫出去，平清盛连忙拨转马头躲避，还是差一点被戳伤。 这次战斗之后平清盛意识到，自己已经老了，再也没有之前那股冲劲了，如果继续拖下去，自己很有可能被年轻的源义经所打败。于是他就主动找上了源赖朝，希望能与他和解。
对于父亲曾经反叛过源赖朝的事情，源义经一直深感内疚，现在听到父亲想要和自己修复关系，他非常高兴，立即派人到平清盛那里表示同意和解。然而当源义经听说母亲正被平清盛软禁的时候，顿时大怒，下令不管付出什么代价都要把母亲救出来。
随后他又亲自率领着一万名士兵向平清盛的巢穴发起进攻，平清盛得知后，不敢怠慢，也率领着一万名士兵迎战。两军在山口县的大井川两岸列阵，这场战争被称为“大井川会战”。
源利仁指挥中军冲向平军的中央，源景祖率左军率先发难，直取平清盛的首级，而源义仲则率领右军乘胜追击，平军在两面夹击中损失惨重，主将平清盛更是被射伤了左手。 虽然平清盛的左臂被打残，但他仍然坚持着不让部下为自己包扎治疗，而是不断鼓励众人，最终带领着他们赢得了这场会战的胜利。
大井川会战以源义的胜利宣告结束，此后不久，源利仁就逼着妻子、即平清盛的女儿妙惠公主自杀殉夫，而平清盛也最终因伤痛而死。 通过一系列的外交、军事行动，源义经不仅终结了平氏的统治，同时也基本终结了源氏内部的争斗。
公元1180年到公元1185年期间发生的“源平讨夷之战”，实际上是由源义经统帅的源氏集团同属于武士阶层的胡族将领之间展开的战斗。